Arna's Children racconta quindici anni di vita di un gruppo teatrale creato nel campo profughi di Jenin, in Cisgiordania, dall'israeliana Arna Mer Khamis. Grazie al denaro di un Premio Nobel alternativo, Arna è riuscita a creare uno spazio in cui i bambini potevano esprimere le loro frustrazioni, paure e traumi causati dalle quotidiane violenze e distruzioni dell'occupazione militare israeliana.

Suo figlio Juliano ha filmato le prove dei bambini dal 1989 al 1996, fino a quando Arna è morta di cancro. Tornato a Jenin nel 2002, Juliano scopre che quasi tutti i giovani attori sono morti, uccisi negli scontri a fuoco con l'esercito o in azioni suicide contro civili israeliani.
Muovendosi avanti e indietro nel tempo e nella vita di ogni singolo protagonista, il film cerca di comprenderne le scelte e le motivazioni.